八核+七卡!泡泡網(wǎng)DIY個人超級計(jì)算機(jī)
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● 蛋白質(zhì)折疊計(jì)算:七卡就是七倍性能!
一般的商業(yè)CUDA軟件都只能支持單GPU,而且無法利用高端顯卡全部的性能,像Badaboom這樣經(jīng)過特別優(yōu)化的軟件也只能支持雙GPU。雖然很多專業(yè)CUDA計(jì)算軟件能支持N多GPU,但民用通用計(jì)算軟件只有Folding@Home(蛋白質(zhì)折疊計(jì)算)和SETI@home(天文數(shù)據(jù)外星文明分析)這兩個分布式計(jì)算支持多GPU。
Folding@home是一個由斯坦福大學(xué)主持,全球主要硬件廠商共同參與的大規(guī)模公益性分布式運(yùn)算項(xiàng)目。其主要是研究了解蛋白質(zhì)折疊、誤折以及相關(guān)的疾病,主要研究的疾病包括:癌癥、阿茲海默癥、亨廷頓病、帕金森氏癥等。我想,這是一個比單純跑各種Benchmark來得更有價(jià)值的事情。將Folding@home程序目錄復(fù)制7份,各自分配不同的機(jī)器號并指定不同的GPU,這樣7個蛋白質(zhì)程序就能互不干涉的各自獨(dú)立運(yùn)行,由于7個程序全靠GPU運(yùn)算,因此CPU占用率非常低,完全不會影響普通2D軟件的運(yùn)行。
運(yùn)行幾個小時(shí)之后,性能估值已經(jīng)出來了,7塊顯卡的PPD分值(Points Per Day每日運(yùn)算得分)都是7000多,總分值高達(dá)53K,已經(jīng)和國內(nèi)第一強(qiáng)人65K的成績相差不遠(yuǎn)了。

通過內(nèi)置的Benchmark測試來看,每片GTX260+都能夠達(dá)到7K左右的PPD,七卡插一起的性能和單卡相比基本沒有損失,但由于網(wǎng)絡(luò)不穩(wěn)的關(guān)系,長時(shí)間運(yùn)行的話,個別數(shù)據(jù)包算出來的平均PPD會有所下降。
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